財政部高雄國稅局表示，依嚴重特殊傳染性肺炎防治及紓困振興特別條例(以下簡稱紓困條例)第9條之1第1項規定，受嚴重特殊傳染性肺炎影響，而依該條例、傳染病防治法第53條或其他法律規定，自政府領取之補貼、補助、津貼、獎勵及補償，免納所得稅。
該局進一步說明，以營利事業而言，取得政府之各項補助款，應列入取得年度之其他收入，依所得稅法第24條規定計算營利事業所得額課稅，惟考量紓困條例提供免稅優惠之立法目的，避免影響紓困補助之發放目的及實質效益，爰明定營利事業取得前述符合紓困條例規定之各項補助，應列為取得年度之免稅收入，並於辦理營利事業所得稅結算申報時，自行依法調整減除該筆免稅收入。
該局舉例說明，甲公司110年度取得符合紓困條例規定之政府補助款新臺幣(下同)20萬元及其他收入15萬元，甲公司於辦理110年度營利事業所得稅結算申報時，應填報申報書第1頁損益及稅額計算表第44欄「其他收入」欄位35萬元，因其中受領符合紓困條例規定之政府補助款20萬元免納所得稅，於辦理營利事業所得稅結算申報時，可自行依法調整減除該筆20萬元補助款收入，以計算全年所得額及應繳納之營利事業所得稅。至於該補助款收入之必要成本及相關費用得核實認列，無須個別歸屬或分攤於該免稅收入。